El Colegio Viena fue creado en 1986 como un proyecto educativo en beneficio de la población guatemalteca, dando oportunidad a niños y jóvenes a prepararse en un colegio de alto nivel académico. En sus inicios se utilizaron las mismas instalaciones académicas que el Instituto Austriaco por lo que las actividades escolares se realizaban en jornada vespertina.
El Colegio Viena Guatemalteco inicia sus funciones en jornada matutina a partir del 2006, en su propio edificio, con los niveles de Educación Preprimaria, Primaria, Básico y Diversificado. Cada año se invierte en mejoras a la infraestructura e instalaciones. A partir del 2019 la Preprimaria se ubica en un área específica y unificada para los tres grados del nivel.